واصل مشروع المساعدة القانونية العمل تحت ظل الظروف السيئة التى أحاطته منذ مشارف نهاية عام 1998 نظرا لما تعرضت له المنظمة المصرية لحقوق الانسان من أحداث مؤسفة - سبق وان تعرضنا لها فى تقرير المنظمة السابق لعامى 99/2000 - ظلت وامتدت حتى عام 2001 بل ازدادت سوء نظرا لعدم تلقى المنظمة أى دعم لتنفيذ مهام المشروع مما اضطر معه مجلس أمناء المنظمة الحالى باتخاذ قرارا